Ugrás a tartalomhoz

DNS-polimeráz κ

Ellenőrzött
A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából
DNS-polimeráz κ
Azonosítók
JelPOLK, DINB1, DINP
Entrez51426
OMIM605650
RefSeqNM_016218
UniProtQ9UBT6
Egyéb adatok
Lokusz5. krom. q13.3

A DNS-polimeráz κ a DNS-polimerázok Y-családjába tartozó enzim, melyet a POLK gén kódol. A transzléziós szintézisben fontos.[1][2][3]

Rendszertan

[szerkesztés]

A DNS-polimeráz κ a DNS-polimerázok Y-családjának DinB alcsaládjába tartozik.[4]

Funkció

[szerkesztés]

A DNS-polimeráz κ csökkenti a gyulladást és a gyulladásindukált mutagenezist dextrán-szulfát-nátrium esetén.[5]

A hibára képes transzléziós szintézisben vesz részt a DNS-polimeráz ι-hoz hasonlóan, és extenderként működik,[6] azonban sokkal gyorsabban – nagyjából a DNS-polimeráz ζ-hoz hasonló, a DNS-polimeráz η-nál vagy ι-nál nagyobb sebességel tud hibák után bővíteni.[7]

Helyesen párosodott végekkel nem produktív komplexet képez, helytelenül párosodottakkal nem.[4] Számos más Y-családbeli DNS-polimeráznál pontosabb, hibagyakorisága 10−4 és 10−3 között van, ennek ok feltehetően az aktív hely kisebb mérete a bejövő nukleozid-trifoszfáthoz és a templáthoz képest a DNS-polimeráz η-hoz képest.[4] Ezenkívül könnyen tud timindimer 3ʹ-végi timinjével, O6-metilguaninnal vagy 8-oxoguaninnal és N2-G-adduktumokkal szemközti nukleotidokat felhasználni bővítésre.[4] Tehát a Pol κ képes primervégi hibákból bővíteni a DNS-t nagy hatékonysággal.[4] E hatások is segítik a benzo[a]pirén letális és mutagén hatásai elleni védelmet.[8]

A DNS-polimeráz κ át tudja ugorni a bázismentes helyeket és az acetilaminofluorén–guanin adduktumokat, azonban a ciszplatinadduktumokat vagy a cisz-szin timindimereket nem.[8]

Klinikai jelentőség

[szerkesztés]

A hibára hajlamos transzléziós szintézisben fontos fehérjeként mutációkat okozhat.[6]

Carlson et al. 2006-ban a DNS-polimeráz κ-nál kimutatták, hogy normál körülmények közt nemproduktív komplexet alkot, ettől eltérőek közt nem. Ezek alapján feltehetően hibás primervégi bázispárokkal rendelkező DNS-ekre fejlődhetett ki, mint amilyenek a transzléziós szintézis bővítési lépésekor jönnek létre.[4]

A POLK-hiányos embrionális őssejtek normálisan növekednek, UV- és röntgensugárzás-érzékenységük csak csekély mértékben tér el, ezzel szemben a benzo[a]pirénre érzékenyebbek, ezenkívül a Polk-hiányos sejtek mutációs spektruma kissé eltér.[8]

Inhibitorok

[szerkesztés]

Bizonyos fehérje-fehérje kölcsönhatások gátlására különböző adjuvánsok használhatók. A kandezartán-cilexetil gátolja a DNS-polimeráz κ-t, a 3-O-metilfunikon szintén gátolja az Y-család polimerázait. Ezek specificitása és hatékonysága nem ismert.[6]

Kölcsönhatások

[szerkesztés]

A DNS-polimeráz κ kölcsönhatásba léphet a REV1-gyel a REV1-kölcsönhatórégió (RIR) révén.[6]

Jegyzetek

[szerkesztés]
  1. Ohashi E, Ogi T, Kusumoto R, Iwai S, Masutani C, Hanaoka F, Ohmori H (2000. augusztus 1.). „Error-prone bypass of certain DNA lesions by the human DNA polymerase κ”. Genes Dev 14 (13), 1589–94. o. DOI:10.1101/gad.14.13.1589. PMID 10887153. PMC 316741. 
  2. Gerlach VL, Aravind L, Gotway G, Schultz RA, Koonin EV, Friedberg EC (1999. november 1.). „Human and mouse homologs of Escherichia coli DinB (DNA polymerase IV), members of the UmuC/DinB superfamily”. Proc Natl Acad Sci U S A 96 (21), 11922–7. o. DOI:10.1073/pnas.96.21.11922. PMID 10518552. PMC 18388. 
  3. Entrez Gene: POLK Polymerase (DNA directed) kappa
  4. a b c d e f Carlson KD, Johnson RE, Prakash L, Prakash S, Washington MT (2006. október 24.). „Human DNA polymerase κ forms nonproductive complexes with matched primer termini but not with mismatched primer termini”. Proc Natl Acad Sci U S A 103 (43), 15776–15781. o. DOI:10.1073/pnas.0605785103. (Hozzáférés: 2024. március 13.) 
  5. Hakura A, Sui H, Seki Y, Sonoda J, Yoshida Y, Takagi H, Yokose S, Matsuda T, Asakura S, Nohmi T (2023. április 22.). „DNA polymerase κ suppresses inflammation and inflammation-induced mutagenesis and carcinogenic potential in the colon of mice”. Genes Environ 45, 15. o, Kiadó: BioMed Central. DOI:10.1186/s41021-023-00272-7. PMID 37087526. PMC 10122296. (Hozzáférés: 2024. március 12.) 
  6. a b c d Yamanaka K, Chatterjee N, Hemann MT,Walker GC (2017. augusztus 17.). „Inhibition of mutagenic translesion synthesis: A possible strategy for improving chemotherapy?”. PLoS Genet 13 (8), e1006842. o. DOI:10.1371/journal.pgen.1006842. (Hozzáférés: 2024. március 12.) 
  7. *Washington MT, Johnson RE, Prakash L, Prakash S (2002). „Human DINB1-encoded DNA polymerase κ is a promiscuous extender of mispaired primer termini”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (4), 1910–4. o. DOI:10.1073/pnas.032594399. PMID 11842189. PMC 122293. 
  8. a b c Ogi T, Shinkai Y, Tanaka K, Ohmori H (2002. november 13.). „Polκ protects mammalian cells against the lethal and mutagenic effects of benzo[apyrene]”. Proc Natl Acad Sci USA 99 (24), 15548–15553. o. DOI:10.1073/pnas.222377899. (Hozzáférés: 2024. március 13.) 

További információk

[szerkesztés]