Actinobacteria
 |
Ez a szócikk vagy szakasz lektorálásra, tartalmi javításokra szorul. |
 | ||
|---|---|---|
| ||
| Rendszertani besorolás | ||
| ||
| Hivatkozások | ||
 A Wikimédia Commons tartalmaz Actinobacteria témájú kategóriát. |
Az Actinobacteriumok a Gram-pozitív baktériumok családjába tartoznak. Lehetnek földi vagy vízi.[1] Nagy gazdasági jelentőségűek az emberek számára, mivel a mezőgazdaság és az erdők a talajrendszerekhez való hozzájárulásuktól függenek. A talajban elősegítik az elhalt organizmusok szerves anyagainak lebontását, így a molekulák újból felvehetők a növények által. Míg ezt a szerepet a gombák is betöltik, az Actinobacteriumok sokkal kisebbek és valószínűleg nem ugyanazt az ökológiai rést foglalják el. Ebben a szerepben a telepek gyakran kiterjedt micéliumot növesztenek, akárcsak egy gomba, és a védettség egyik fontos rendjének neve, az Actinomycetales (az aktinomicéták) azt tükrözi, hogy sokáig gombának hitték őket. Egyes talajaktinobaktériumok (például a Frankia ) szimbiotikusan élnek a növényekkel, amelyek gyökerei áthatolnak a talajon, nitrogénet kötve a növényekért cserébe a növény egyes szacharidjaihoz való hozzáférésért. Más fajok, például a Mycobacterium nemzetség számos tagja, fontos kórokozók .
Az Actinobacteriumok iránti talajszerepük iránti nagy érdeklődésen túl sok mindent meg kell még tanulni róluk. Bár jelenleg elsősorban talajbaktériumként értik őket, az édesvízben előfordulhat, hogy nagyobb mennyiségben fordul elő.[2] Az aktinobaktériumok az egyik domináns bakteriális phyla, és az egyik legnagyobb baktérium nemzetséget, a Streptomyces-t tartalmazza.[3] A Streptomyces és más aktinobaktériumok a talaj biológiai pufferelésének fő hozzájárulói.[4] Számos antibiotikum is ezek forrása.
Noha a legnagyobb és legösszetettebb baktériumsejtek egy része az Actinobacteriumokhoz tartozik, a tengeri Actinomarinales csoportról azt írták, hogy a legkisebb szabadon élő prokarióta sejtekkel rendelkezik.[5]
Egyes szibériai vagy antarktiszi aktinobaktériumok állítólag a Föld legöregebb élő organizmusai, amelyek félmillió évvel ezelőtt örökfagyba fagytak.[6][7] Az élet tüneteit a CO CO felszabadulás a 640 kya vagy annál fiatalabb permafrost mintákból.[8]
A legtöbb orvosi vagy gazdasági jelentőségű Actinobacterium az Actinobacteridae alosztályba tartozik, és az Actinomycetales rendjébe tartozik. Míg ezek közül sok emberben betegséget okoz, a Streptomyces az antibiotikumok forrásaként figyelemre méltó.
Az Actinomycetalesben nem szereplő Actinobacteriumok közül a Gardnerella az egyik leginkább kutatott. A Gardnerella osztályozása ellentmondásos, és a MeSH mind Gram-pozitív, mind Gram-negatív szervezetként katalogizálja.
Az aktinobaktériumokat, különösen a Streptomyces spp. Számos bioaktív metabolit termelőjeként ismerik el, amelyek az ember számára hasznosak az orvostudományban, mint például antibakteriális szerek,[9] gombaellenes szerek,[10] vírusellenes szerek, antitrombotikus szerek, immunmodifikátorok, daganatellenes szerek és enzimgátlók; és a mezőgazdaságban, ideértve a rovarölő, gyomirtó, gombaölő és a növények és állatok növekedését elősegítő anyagokat.[11][12] Az orvostudományban fontos aktinobaktériumokból származó antibiotikumok közé tartoznak az aminoglikozidok, antraciklinek, klóramfenikol, makrolidok, tetraciklinek stb.
Az aktinobaktériumok DNS-ében magas guanin- és citozintartalom található.[13] Az Actinobacteriumok G + C tartalma akár 70% is lehet, bár egyesek alacsony G + C tartalommal bírhatnak.[14]
A glutamin-szintetáz szekvencia elemzését javasolták az Actinobacteriumok filogenetikai elemzéséhez.[15]
Törzsfejlődés
[szerkesztés]A filogenitás a 'The All-Species Living Tree' Project 16S rRNS-alapú LTP 123. kiadásán alapul.
Rendszertan
[szerkesztés]Megjegyzések: ♠ A Biotechnológiai Információk Nemzeti Központja (NCBI) adatbázisában található törzsek, amelyek nem szerepelnek a Nómenklatúrában álló prokarióta nevek listájában (LSPN)
- Species "Cathayosporangium alboflavum" ♠ Runmao et al. 1995
- Species "Candidatus Planktophila limnetica" Jezbera et al. 2009
- Species "Tonsillophilus suis" ♠ Azuma and Bak 1980
- Class Rubrobacteria Suzuki 2013 (Rubrobacteridae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Order Rubrobacterales Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Family Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997
- Order Rubrobacterales Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Class Thermoleophilia Suzuki & Whitman 2013 (Thermoleophilidae)
- Order Gaiellales Albuquerque et al. 2012
- Family Gaiellaceae Albuquerque et al. 2012
- Order Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009
- Family Thermoleophilaceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
- Family Conexibacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Family Patulibacteraceae Takahashi et al. 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Family Solirubrobacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi et al. 2009
- Order Gaiellales Albuquerque et al. 2012
- Class Coriobacteriia Konig 2013 emend. Gupta et al. 2013 (Coriobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Order Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
- Family Atopobiaceae Gupta et al. 2013
- Family Coriobacteriaceae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Eggerthellales Gupta et al. 2013
- Family Eggerthellaceae Gupta et al. 2013
- Order Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
- Class Acidimicrobiia Norris 2013 (Acidimicrobidae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Order Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009 [Acidimicrobineae Garrity, Bell & Lilburn 2003]
- Family Acidimicrobiaceae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Family Iamiaceae Kurahashi et al. 2009
- Family "Microthrixaceae" Joseph et al. 2003
- Order Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009 [Acidimicrobineae Garrity, Bell & Lilburn 2003]
- Class Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013 (Nitriliruptoridae Kurahashi et al. 2010)
- Order Egibacterales Zhang et al. 2016
- Family Egibacteraceae Zhang et al. 2016
- Order Egicoccales Zhang et al. 2015
- Family Egicoccaceae Zhang et al. 2015
- Order Euzebyales Kurahashi et al. 2010
- Family Euzebyaceae Kurahashi et al. 2010
- Order Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009
- Family Nitriliruptoraceae Sorokin et al. 2009
- Order Egibacterales Zhang et al. 2016
- Class Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 (Actinobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Species ?"Boyliae praeputiale" ♠ Yates et al. 2002
- Order ?"Actinomarinales" Ghai et al. 2013 ["Actinomarinidae" Ghai et al. 2013]
- Family "Actinomarinaceae" Ghai et al. 2013
- Order Acidothermales Sen et al. 2014
- Family Acidothermaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Order "Catenulisporales" Donadio et al. 2012 (Catenulisporineae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009)
- Family Actinospicaceae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
- Family Catenulisporaceae Busti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
- Order "Streptomycetales" Kampfer 2012 (Streptomycetineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Family Streptomycetaceae Waksman & Henrici 1943 emend. Zhi et al. 2009
- Order Geodermatophilales Sen et al. 2014
- Family Geodermatophilaceae Normand 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Frankiales Sen et al. 2014 (Frankineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Motilibacteraceae Lee 2013
- Family Cryptosporangiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Family Frankiaceae Becking 1970 emend. Zhi et al. 2009
- Family Sporichthyaceae Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Nakamurellales Sen et al. 2014
- Family Nakamurellaceae Tao et al. 2004 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009 [Microsphaeraceae Rainey et al. 1997]
- Order "Kineosporiales" Kampfer 2012 (Kineosporineae Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Kineosporiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Micrococcales Prevot 1940 [Arthrobacteria; Micrococcineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Yassin et al. 2011; incl. Flavobacterium oceanosedimentum; Bifidobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Actinomycetales Buchanan 1917 emend. Zhi et al. 2009]
- Family Intrasporangiaceae
- Family Microbacteriaceae
- Family Cellulomonadceae
- Family Promicromonosporaceae
- Family Sanguibacteraceae
- Family Rarobacteraceae
- Family Jonesiaceae
- Family Bogoriellaceae
- Family Beutenbergiaceae
- Family Ruaniaceae
- Family Actinomycetaceae
- Family Demequinaceae
- Family Dermabacteraceae
- Family Brevibacteriaceae
- Family Micrococcaceae (incl. Bifidobacteriaceae)
- Order "Propionibacteriales" Patrick & McDowell 2012 (Propionibacterineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Family Nocardioidaceae
- Family Propionibacteriaceae
- Order "Streptosporangiales" Goodfellow 2012 (Streptosporangineae Ward-Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Streptosporangiaceae
- Family Nocardiopsaceae
- Family Thermomonosporaceae
- Order "Jiangellales" Tang et al. 2012 (Jiangellineae Tang et al. 2011)
- Family Jiangellaceae Tang et al. 2011
- Order "Glycomycetales" Labeda 2012 (Glycomycetineae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Glycomycetaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order "Micromonosporales" Genilloud 2012 (Micromonosporineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Actinoplanales]
- Family Micromonosporaceae
- Order "Pseudonocardiales" Labeda & Goodfellow 2012 (Pseudonocardineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Labeda et al. 2011)
- Family Pseudonocardiaceae
- Order "Corynebacteriales" Goodfellow & Jones 2012 (Corynebacterineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009<meta />; Mycobacteria)
- Family Segniliparaceae
- Family Nocardiaceae [Gordoniaceae; Williamsiaceae]
- Family Dietziaceae
- Family Corynebacteriaceae
- Family Tsukamurellaceae
- Family Mycobacteriaceae
Jegyzetek
[szerkesztés]- ↑ (2008. január 1.) „Evidence excluding the root of the tree of life from the actinobacteria”. Mol. Biol. Evol. 25 (1), 1–4. o. DOI:10.1093/molbev/msm249. PMID 18003601.
- ↑ (2011) „Metagenomics of the water column in the pristine upper course of the Amazon river”. PLOS ONE 6 (8), e23785. o. DOI:10.1371/journal.pone.0023785. PMID 21915244.
- ↑ C.Michael Hogan.. 2010. Bacteria. Encyclopedia of Earth. eds. Sidney Draggan and C.J.Cleveland, National Council for Science and the Environment, Washington DC Archiválva 2011. május 11-i dátummal a Wayback Machine-ben.
- ↑ Ningthoujam (2009. november 1.). „Antagonistic activities of local actinomycete isolates against rice fungal pathogens”. African Journal of Microbiology Research 3 (11), 737–742. o.
- ↑ (2013) „Metagenomics uncovers a new group of low GC and ultra-small marine Actinobacteria”. Scientific Reports 3, 2471. o. DOI:10.1038/srep02471. PMID 23959135.
- ↑ Sussman: Oldest Plants, The Guardian, 2 May 2010
- ↑ It's Okay to be Smart • the oldest living thing in the world: These. [2018. július 13-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2018. július 13.)
- ↑ Johnson (2007). „Ancient bacteria show evidence of DNA repair”. Proceedings of the National Academy of Sciences 104 (36), 14401–14405. o. DOI:10.1073/pnas.0706787104. PMID 17728401.
- ↑ Mahajan (2012). „Antibacterial agents from actinomycetes - a review”. Frontiers in Bioscience 4, 240–53. o. DOI:10.2741/e373.
- ↑ Gupte (2002). „Antifungal Antibiotics”. Appl. Microbiol. Biotechnol. 58 (1), 46–57. o. DOI:10.1007/s002530100822. PMID 11831475.
- ↑ Bressan (2003). „Biological control of maize seed pathogenic fungi by use of actinomycetes”. Biocontrol 48 (2), 233–240. o. DOI:10.1023/a:1022673226324.
- ↑ Atta (2009). „Antimycin-A Antibiotic Biosynthesis Produced by Streptomyces Sp. AZ-AR-262: Taxonomy, Fermentation, Purification and Biological Activities”. Austral. J. Basic and Appl. Sci. 3, 126–135. o.
- ↑ Ventura (2007. szeptember 5.). „Genomics of Actinobacteria: Tracing the Evolutionary History of an Ancient Phylum”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 71 (3), 495–548. o. DOI:10.1128/MMBR.00005-07. PMID 17804669.
- ↑ (2012) „Breaking a paradigm:cosmopolitan and abundant freshwater actinobacteria are low GC”. Environmental Microbiology Reports 4 (1), 29–35. o. DOI:10.1111/j.1758-2229.2011.00274.x. PMID 23757226.
- ↑ (2009) „Glutamine synthetase sequence evolution in the mycobacteria and their use as molecular markers for Actinobacteria speciation”. BMC Evol. Biol. 9, 48. o. DOI:10.1186/1471-2148-9-48. PMID 19245690.
További információk
[szerkesztés]- (2004) „Studies on the antibacterial activity of the Actinomycetes isolated from the Khumbu Region of Nepal”. International Conference on the Great Himalayas: Climate, Health, Ecology, Management and Conservation. [2013. augusztus 10-i dátummal az eredetiből archiválva]. Hozzáférés: 2021. február 27.
- Baltz (2005). „Antibiotic discovery from actinomycetes: Will a renaissance follow the decline and fall?”. SIM News 55, 186–196. o.
- Baltz (2007). „Antimicrobials from Actinomycetes: Back to the Future”. Microbe 2 (3), 125–131. o. [2013. december 31-i dátummal az eredetiből archiválva].
Fordítás
[szerkesztés]- Ez a szócikk részben vagy egészben az Actinobacteria című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.
