OpenBioMaps
Az OpenBioMaps egy biológiai témájú adatbázisok és adatok kezelésére létrehozott platform. Az OpenBioMaps célja, hogy biodiverzitással kapcsolatos adatok kezeléséhez biztosítson technikai hátteret.[1] Az OpenBioMaps fejlesztést és publikus szolgáltatásokat az OpenBioMaps konzorcium felügyeli. A konzorcium a Debreceni Egyetem, Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság, ELTE és a WWF Magyarország együttműködésével 2015. szeptember elsején jött létre.
OpenBioMaps koncepció
[szerkesztés]Az OpenBioMaps egy koncepció is egyúttal a fenntartható tudományos-természetvédelmi adatbázis üzemeltetésről. A koncepció lényege, hogy egy olyan rendszert hozzunk létre aminek alacsony az üzemeltetési költsége és elosztott módon üzemel. Az elosztottság abban nyilvánul meg, hogy a publikus szolgáltatások olyan szervereken futnak amit egymástól független szervezetek tartanak fenn. Ezeknek a szervereknek a fenntartási célja is független egymástól, többnyire saját belső adatbázis kezelési igények kielégítése, aminek "melléktermékeként" nyújtanak publikus szolgáltatásokat az egyes partnerek.[2]
Publikus szolgáltatások
[szerkesztés]- egyéni adatbázisok létrehozása és üzemeltetése[3]
- egyszerű adat importálás változatos formátumokból (xls, csv, gpx, shp, ods, fasta, képfájlok,...)
- ismételhető és hivatkozható lekérdezések[4]
- DataCite DOI az adatbázisoknak és lekérdezéseknek[4]
- adatok exportálása különféle formátumokba (gpx, csv)
- adat elérés távoli adatbázisokból vagy asztali alkalmazásokból (pl. R, QGIS)
- egyénre szabható adatkezelő felületek
- egyedileg szabályozható adatgyűjtő felületek
- egyéni modulok fejlesztése és integrálása
Nyílt forráskódú szoftverek
[szerkesztés]Az OpenBioMaps különféle nyílt forráskódú szoftverek együttes felhasználásával és nyílt forráskódú alkalmazások megírásával létrehozott szoftver rendszer.
Felhasznált szoftverek és keretrendszerek:[5][6]
- Debian Linux
- Apache webszerver
- UMN Mapserver
- PHP
- PostgreSQL
- PostGIS
- PureCSS
- OpenLayers
- Docker
- Vue JS
- React Native
- R
- Perl
OpenBioMaps szerverek
[szerkesztés]- DINPI (Budapest, üzemelteti: Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság, használják: DINPI, DDNPI, ONPI és van publikus szerver része is.)
- ELTE (Budapest, üzemelteti: ELTE)
- Flóraatlasz (Sopron, üzemelteti: Soproni Egyetem, használja: Flóraatlasz projekt)
- BNPI (üzemelteti: Bükki Nemzeti Park Igazgatóság, használja: BNPI, ANPI)
- HNP (üzemelteti: Hortobágyi Nemzeti Park Igazgatóság, használja: HNP)
- KNP (Kecskemét, üzemelteti: Kiskunsági Nemzeti Park Igazgatóság, használja: KNP)
- FHNPI (üzemelteti: Fertő-Hanság Nemzeti Park Igazgatóság, használja: FHNPI)
- HNP (üzemelteti: Hortobágyi Nemzeti Park Igazgatóság, használja HNP)
- Debrecen (Debrecen, üzemelteti: Debreceni Egyetem, használják: többnyire egyetemi projektek)
- MILVUS (Marosvásárhely, Románia, üzemelteti: MILVUS, használja: többnyire MILVUS projektek)
- ÖK (Vácrátót, üzemelteti: Ökológiai Kutatóközpont)
- NHMUS[halott link] (Budapest, Magyar Természettudományi Múzeum)
Az aktuálisan elérhető ismert szerverek listája itt érhető el: https://openbiomaps.org/projects/openbiomaps_network/
OpenBioMaps Konzorcium
[szerkesztés]Az OpenBioMaps konzorcium partnerei az alapító tagok (Debreceni Egyetem, ELTE, DINPI, WWF Magyarország) és az azóta csatlakozott Eszterházi Károly Egyetem és Milvus Group Association, Duna-Dráva Nemzeti Park Igazgatóság és a Fertő-Hanság Nemzeti Park Igazgatóság.
OpenBioMaps rendezvények
[szerkesztés]2014.09.19-20 I. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet, Debrecen.[7]
2016.08.23-24 OpenBioMaps munkaértekezlet, Eger.
2017.11.02 Felhasználói kurzus (Természetvédelmi Biológiai Konferencián), Eger[8]
2018.09.25-28 I. OpenBioMaps "Autumn Coding", Debrecen
2018.11.06-10 II. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet és codecamp, Fertőújlak.[9]
2019.02.? I. OpenBioMaps "Spring Codecamp", Parajd, Románia.
2019.06.27-29 OpenBioMaps kurzus és terepgyakorlat, Tápiószentmárton.
2019.08.25-26 OpenBioMaps kurzus, Kolozsvár, Románia.[10]
2019.10.07-09 III. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet és codecamp, Hortobágy.[11]
2021.09.10-15 IV. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet és codecamp, Szaporca.
További információk
[szerkesztés]Hivatkozások
[szerkesztés]- ↑ http://www.matud.iif.hu/2015/03/09.htm
- ↑ https://www.biorxiv.org/content/early/2014/10/16/010405
- ↑ http://www.europarc.org/wp-content/uploads/2015/03/WS3_Monitoring-biodiversity_Ban.pdf
- ↑ a b Archivált másolat. [2017. november 7-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2017. október 30.)
- ↑ OpenBioMaps (angol nyelven). GitLab. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
- ↑ https://github.com/openbiomaps/
- ↑ Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék. zoology.unideb.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
- ↑ XI. Magyar Természetvédelmi Biológiai Konferencia. www.mtbk.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
- ↑ Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék. zoology.unideb.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
- ↑ Pre-congress (brit angol nyelven). EOU 2019 Conference. [2019. december 26-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
- ↑ Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék. zoology.unideb.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)