Ugrás a tartalomhoz

OpenBioMaps

Ellenőrzött
A Wikipédiából, a szabad enciklopédiából

Az OpenBioMaps egy biológiai témájú adatbázisok és adatok kezelésére létrehozott platform. Az OpenBioMaps célja, hogy biodiverzitással kapcsolatos adatok kezeléséhez biztosítson technikai hátteret.[1] Az OpenBioMaps fejlesztést és publikus szolgáltatásokat az OpenBioMaps konzorcium felügyeli. A konzorcium a Debreceni Egyetem, Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság, ELTE és a WWF Magyarország együttműködésével 2015. szeptember elsején jött létre.

OpenBioMaps koncepció

[szerkesztés]

Az OpenBioMaps egy koncepció is egyúttal a fenntartható tudományos-természetvédelmi adatbázis üzemeltetésről. A koncepció lényege, hogy egy olyan rendszert hozzunk létre aminek alacsony az üzemeltetési költsége és elosztott módon üzemel. Az elosztottság abban nyilvánul meg, hogy a publikus szolgáltatások olyan szervereken futnak amit egymástól független szervezetek tartanak fenn. Ezeknek a szervereknek a fenntartási célja is független egymástól, többnyire saját belső adatbázis kezelési igények kielégítése, aminek "melléktermékeként" nyújtanak publikus szolgáltatásokat az egyes partnerek.[2]

Publikus szolgáltatások

[szerkesztés]
  • egyéni adatbázisok létrehozása és üzemeltetése[3]
  • egyszerű adat importálás változatos formátumokból (xls, csv, gpx, shp, ods, fasta, képfájlok,...)
  • ismételhető és hivatkozható lekérdezések[4]
  • DataCite DOI az adatbázisoknak és lekérdezéseknek[4]
  • adatok exportálása különféle formátumokba (gpx, csv)
  • adat elérés távoli adatbázisokból vagy asztali alkalmazásokból (pl. R, QGIS)
  • egyénre szabható adatkezelő felületek
  • egyedileg szabályozható adatgyűjtő felületek
  • egyéni modulok fejlesztése és integrálása

Nyílt forráskódú szoftverek

[szerkesztés]

Az OpenBioMaps különféle nyílt forráskódú szoftverek együttes felhasználásával és nyílt forráskódú alkalmazások megírásával létrehozott szoftver rendszer.

Felhasznált szoftverek és keretrendszerek:[5][6]

OpenBioMaps szerverek

[szerkesztés]

- DINPI (Budapest, üzemelteti: Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság, használják: DINPI, DDNPI, ONPI és van publikus szerver része is.)

- ELTE (Budapest, üzemelteti: ELTE)

- Flóraatlasz (Sopron, üzemelteti: Soproni Egyetem, használja: Flóraatlasz projekt)

- BNPI (üzemelteti: Bükki Nemzeti Park Igazgatóság, használja: BNPI, ANPI)

- HNP (üzemelteti: Hortobágyi Nemzeti Park Igazgatóság, használja: HNP)

- KNP (Kecskemét, üzemelteti: Kiskunsági Nemzeti Park Igazgatóság, használja: KNP)

- FHNPI (üzemelteti: Fertő-Hanság Nemzeti Park Igazgatóság, használja: FHNPI)

- HNP (üzemelteti: Hortobágyi Nemzeti Park Igazgatóság, használja HNP)

- Debrecen (Debrecen, üzemelteti: Debreceni Egyetem, használják: többnyire egyetemi projektek)

- MILVUS (Marosvásárhely, Románia, üzemelteti: MILVUS, használja: többnyire MILVUS projektek)

- ÖK (Vácrátót, üzemelteti: Ökológiai Kutatóközpont)

- NHMUS[halott link] (Budapest, Magyar Természettudományi Múzeum)


Az aktuálisan elérhető ismert szerverek listája itt érhető el: https://openbiomaps.org/projects/openbiomaps_network/

OpenBioMaps Konzorcium

[szerkesztés]

Az OpenBioMaps konzorcium partnerei az alapító tagok (Debreceni Egyetem, ELTE, DINPI, WWF Magyarország) és az azóta csatlakozott Eszterházi Károly Egyetem és Milvus Group Association, Duna-Dráva Nemzeti Park Igazgatóság és a Fertő-Hanság Nemzeti Park Igazgatóság.

OpenBioMaps rendezvények

[szerkesztés]

2014.09.19-20 I. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet, Debrecen.[7]

2016.08.23-24 OpenBioMaps munkaértekezlet, Eger.

2017.11.02 Felhasználói kurzus (Természetvédelmi Biológiai Konferencián), Eger[8]

2018.09.25-28 I. OpenBioMaps "Autumn Coding", Debrecen

2018.11.06-10 II. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet és codecamp, Fertőújlak.[9]

2019.02.? I. OpenBioMaps "Spring Codecamp", Parajd, Románia.

2019.06.27-29 OpenBioMaps kurzus és terepgyakorlat, Tápiószentmárton.

2019.08.25-26 OpenBioMaps kurzus, Kolozsvár, Románia.[10]

2019.10.07-09 III. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet és codecamp, Hortobágy.[11]

2021.09.10-15 IV. Biológiai adatbázisok és adattárolás munkaértekezlet és codecamp, Szaporca.

További információk

[szerkesztés]

Hivatkozások

[szerkesztés]
  1. http://www.matud.iif.hu/2015/03/09.htm
  2. https://www.biorxiv.org/content/early/2014/10/16/010405
  3. http://www.europarc.org/wp-content/uploads/2015/03/WS3_Monitoring-biodiversity_Ban.pdf
  4. a b Archivált másolat. [2017. november 7-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2017. október 30.)
  5. OpenBioMaps (angol nyelven). GitLab. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
  6. https://github.com/openbiomaps/
  7. Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék. zoology.unideb.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
  8. XI. Magyar Természetvédelmi Biológiai Konferencia. www.mtbk.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
  9. Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék. zoology.unideb.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
  10. Pre-congress (brit angol nyelven). EOU 2019 Conference. [2019. december 26-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2019. december 26.)
  11. Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék. zoology.unideb.hu. (Hozzáférés: 2019. december 26.)